Super Animes

O estúdio de animação Bones adaptou o mangá em um animê de 51 episódios, que foram transmitidos na televisão japonesa do dia 4 de outubro de 2003 até o dia 2 de outubro de 2004. Um filme, Fullmetal Alchemist: Conqueror of Shambala foi produzido pelo mesmo estúdio, e foi lançado nos cinemas japoneses no dia 23 de julho de 2005.
Como o mangá ainda não estava finalizado no período de produção do animê, as duas linhas se separam e começam a seguir caminhos diferentes mais ou menos a partir da metade da série. Hiromu, a criadora do mangá, divulgou que o fim da série televisiva é completamente diferente do planejado por ela.

No Brasil

No Brasil o anime continua sendo exibido desde 2005, pelo canal pago Animax, na sua versão original sem cortes, dublados em português brasileiro mas mantendo abertura e encerramentos em japonês. Em Junho de 2006, Fullmetal Alchemist estréia junto com o novo bloco de desenhos da RedeTV!, Tv Kids. Nessa versão o anime sofreu vários cortes devido ao seu horário de exibição (12:00 e 02:00 horas). Mas ele foi novamente exibido na mesma RedeTV!, no primeiro e segundo bloco da Tv Kids.
Também foram lançados DVDs da série pela Focus Filmes.
O mangá está sendo publicado pela Editora JBC, e atualmente, foram lançados 50 volumes (correspondendo ao volume 25 original).

Em Portugal

Em Portugal, o anime é exibido desde 2009, pelo canal de cabo SIC Radical, na sua versão original sem cortes, não dublada ("dobrada" em português europeu), mantendo-se o idioma original (japonês) com legendas em português europeu. O canal Animax não passa este anime em Portugal.